澳大利亞肺魚擁有已測(cè)序最大動(dòng)物基因組
共含430億對(duì)堿基 超過(guò)人類基因組14倍
據(jù)英國(guó)《新科學(xué)家》雜志網(wǎng)站18日?qǐng)?bào)道，奧地利分子病理學(xué)研究所的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)，澳大利亞肺魚擁有迄今已測(cè)序所有動(dòng)物最大的基因組，其基因組共包含430億對(duì)堿基，超過(guò)人類基因組14倍。
最新研究負(fù)責(zé)人齊格弗里德·斯克洛斯寧表示，此前最大已測(cè)序動(dòng)物基因組來(lái)自墨西哥兩棲動(dòng)物美西螈。2018年他們對(duì)其進(jìn)行了測(cè)序，但澳大利亞肺魚的基因組比其還大30%。
在最新研究中，科學(xué)家們使用高性能計(jì)算機(jī)測(cè)序儀將肺魚的基因組拼接起來(lái)。為解決測(cè)序儀可能造成的錯(cuò)誤，研究人員使用了基因組的多個(gè)拷貝，每個(gè)拷貝都被分割成DNA小塊。在對(duì)所有片段進(jìn)行測(cè)序后，研究小組使用算法將片段重組成一個(gè)完整的基因組。斯克洛斯寧估計(jì)，得到結(jié)果需要計(jì)算機(jī)處理大約10萬(wàn)小時(shí)。
斯克洛斯寧說(shuō)，澳大利亞肺魚原產(chǎn)于昆士蘭州東南部，該動(dòng)物從水基生活方式過(guò)渡到陸基生活方式以來(lái)，其外貌幾乎沒(méi)有什么變化。
此前，科學(xué)家們并不清楚肺魚和腔棘魚(一種發(fā)現(xiàn)于印度洋和印度尼西亞周圍的古老魚類)誰(shuí)與哺乳動(dòng)物和鳥類等陸地脊椎動(dòng)物的關(guān)系更密切。新基因組分析明確指出，肺魚與四足動(dòng)物的祖先關(guān)系更密切。腔棘魚較早從這些動(dòng)物中分化出來(lái);而肺魚在4.2億年前才與這些動(dòng)物分道揚(yáng)鑣。
斯克洛斯寧說(shuō)：“為離開水，肺魚需要適應(yīng)陸地的生活方式，必須能呼吸空氣，必須能聞到氣味。肺魚背部擁有一個(gè)肺，供其呼吸水面上的空氣。”
在與肺和關(guān)節(jié)肢體的發(fā)育以及嗅探氣味有關(guān)基因的數(shù)量方面，澳大利亞肺魚與兩棲動(dòng)物相似。斯克洛斯寧說(shuō)：“從基因組角度而言，澳大利亞肺魚的基因組介于魚類和陸地脊椎動(dòng)物之間。”(記者劉霞)
關(guān)鍵詞： 澳大利亞肺魚
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